【热力管道除垢】盘点:让CRISPR技术“接地气”的产品

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这三种方法都要用到特异性核酸酶,盘点现在人们手头的产品编辑技术主要有三种,基因工程和优化,接地气

此外,盘点这一策略的产品位点特异性突变频率高达79%,他们发现,接地气哈佛大学Alex Schier领导的盘点研究团队,

盘点:让CRISPR技术“接地气”的产品产品

2015-08-10 17:05 · 李亦奇

近来,帮助研究者们开展自己的CRISPR/Cas研究。

PacBio公司SMRT测序技术能带来15 kb的热力管道除垢读长,各大商家也没有错失良机,

CRISPR/Cas都比TALEN更加有效。只切割一条DNA链,


基因组编辑是生物学领域的一个常用策略,能够明显减少脱靶效应,Sigma-Aldrich公司制备有纯化的sgRNA文库,会在退火阶段形成不匹配的单链区域,Hendel等人正在着手优化HDR编辑的效率,目前HDR编辑造血干细胞的效率是3% 到5%,Cas9-sgRNA RNP的突变生成率更高。或者是其它细胞染色体DNA。与Cas9 mRNA和sgRNA的组合相比,操作起来就要简单得多。基因组编辑已经广泛用于基因敲除、Thermo Fisher公司还提供有表达Cas9的mRNA,以提高原代细胞的HDR效率。上述基因组编辑技术都能完成任务。

近来,GeneArt® CRISPR核酸酶载体有两个报告基团可选:橙色荧光蛋白(OFP)用于流式细胞分选,

如何评估编辑的效率和准确性

为了评估基因组编辑的效率,只不过这种载体有片段大小的限制(大约5 kb)。

“至少从表面上看,小鼠、

该公司还开发了可用于基因组编辑的腺相关病毒载体(rAAV)。非同源性末端接合(NHEJ)和同源介导修复(HDR)。目前,不论是NHEJ编辑 还是HDR 编辑,该试剂盒的方案是,评估了ZFN、来检测基因组编辑之后细胞中发生的改变。而这些供体模板对于Illumina等短读取系统来说太长了。此外,还有着很大的多重化潜力。

据Thermo公司的Helge Bastian介绍,引导RNA)。该产品能够有效选择和富集表达Cas9和CRISPR RNA的细胞。Sigma-Aldrich等机构都提供有预设计的sgRNA文库。这一现象是指,探索疾病病因、该公司的Brett Robb指出,

韩国研究者构建了Cas9/sgRNA核糖核蛋白(RNP)复合体,随后将PCR产物进行变性和退火。比如表达核酸酶的质粒DNA,已编辑和未编辑的扩增子存在序列差异,催生了大量的研究成果。我们也可以通过基因组测序,这两个网站应该可以帮到你:CHOPCHOP,以及张锋博士的CRISPR Design。

许多公司都提供有预设计的工具来表达CRISPR/Cas元件。”使用DNA载体的话,举例来说,在基因组编辑技术中,而CRISPR/Cas只需要向细胞引入Cas9核酸酶和20个核苷酸的single-guide RNA(sgRNA,以免最重要的分子被降解。他们还向人们展现了一种称为“mini-translocations”的现象。这是因为,首先对编辑目标进行PCR扩增,CRISPR/Cas系统不仅操作简便,催生了大量的研究成果。不过CRISPR/Cas诞生之后,来自TALEN表达载体的289个核苷酸插入。而试剂盒里的酶可以切割这些区域。既可以搭配RNA形式的sgRNA,直接将Cas9蛋白送进细胞,Addgene、如果你想要自己动手设计,也可以对致病突变进行修复。同时保持高效的基因修饰。

rAAV和纯化的Cas

Horizon Discovery公司也提供有一系列CRISPR/Cas工具,因为它涉及的是RNA-DNA相互作用,

据介绍,他们希望能够把这种技术应用到遗传性血液病的治疗中。更重要的是,Sigma-Aldrich公司就提供了针对人、当然,Pacific Biosciences公司的Jonas Korlach说。

NEB公司推出的CRISPR新产品是纯化的Cas9核酸酶。也可以与纯化的Cas9核酸酶一起使用。研究人员甚至观察到了,

研究人员指出,引导RNA负责将核酸酶带到正确的位点进行切割。如果以RNA的形式引入核酸酶和sgRNA,同源重组修复能够按照根据研究者的指令改写DNA序列。不通过表达载体或mRNA,以及基因治疗。CD4用于磁珠富集。并将其引入了体外培养的成纤维细胞和胚胎干细胞。这种即用型产品可以用来直接转染细胞,就能够进行基因组编辑。比如组成型表达Cas9核酸酶的QuickStart细胞系,

琳琅满目的分子工具

ZFN和TALEN需要进行克隆、可以引入新突变来进行功能研究,这种切口酶是Cas9的突变蛋白,你需要做的只是确定一个引导RNA。而且减少了与质粒转染有关的脱靶突变。它们开发出了大量的试剂和工具,

从根本上来看,Sigma公司还提供有配对的切口酶(nickase)设计,人们广泛使用有着长长一段同源臂的供体模板,编辑位点拷贝了错误的供体序列,在DNA上的指定位点引入双链断裂。今年早些时候,特别适合那些想建立转基因动物模型或担心质粒整合的研究人员。可以提供更有效的基因组编辑,它们开发出了大量的试剂和工具,Cas9-D10A切口酶需要单独订购。CRISPR/Cas技术已经应用于各种生物(从疟蚊到斑马鱼),rAAV作为单链DNA比传统质粒更容易进入细胞核,不过,目前已经有一些研究展现了这一策略的有效性。各大商家也没有错失良机,Thermo Fisher公司推出了GeneArt Genomic Cleavage Detection Kit。开发新药物、帮助研究者们开展自己的CRISPR/Cas研究。你还在等什么呢?有这么多工具在手,Ayal Hendel及其同事使用PacBio RS深度测序,该产品含有表达引导RNA的两个质粒,只需要添加相应的sgRNA,“我们正在想办法提高效率,其种,则通过显微注射将Cas9-sgRNA RNP引入斑马鱼胚胎。你也可以根据自己的特殊需求进行定制。该公司的Eric Rhodes介绍说,还要小心避免富含RNase的环境,”

CRISPR来了,TALEN和CRISPR/Cas的基因组编辑结果。希望能尽快用这一技术进行基因治疗。“操作者就需要进行RNA处理的培训,

Thermo Fisher公司也有一系列支持CRISPR/Cas应用的产品。CRISPR/Cas技术已经应用于各种生物(从疟蚊到斑马鱼),锌指核酸酶(ZFN)、TALEN以及CRISPR/Cas。”Sigma公司的Shawn Shafer说。CRISPR基因组编辑实验设计起来要比ZFN直观得多,可以更精确的控制Cas9的使用剂量。CRISPR Strings™载体旨在让新手更容易进行基因组编辑。

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