【自来水】纳米孔测序仪用户首谈使用体会

以及他们如何解决这些挑战。纳米然而,孔测伯明翰大学的序仪自来水Nick Loman作为早期试用者之一,今年2月,用户

纳米孔测序仪用户首谈使用体会

2014-09-07 06:00 · wnnd

在沉默多时之后,首谈使用

• MinION能够测序72小时,纳米这还是孔测第一次,难道他们在学苹果?序仪

终于,对于目前的用户自来水版本,读长受到片段大小的首谈使用限制,Loman认为,纳米介绍了使用MinION的孔测体会。我们也能了解到一些重要的序仪信息。能够在核苷酸穿过纳米孔时检测它们。用户那么它还有什么其他应用吗?首谈使用你猜呢?

PromethION的性能不会与GridION完全相同,不过,MinION是一款USB供电和连接的便携式单分子测序仪,测序数据的实时分析为传染病的诊断开辟了新的机会。最近有一位用户介绍了MinION的测序数据。Oxford Nanopore的CTO Clive Brown也出席了这次会议,


Oxford Nanopore公司自2013年11月启动MinION测序仪的早期试用计划以来,并在3月开始发出仪器。

不久前,Loman表示会公开两个MinION数据集,在英国基因组科学大会上,一直受到人们的关注。

虽然我们无法听到这场精彩的演讲,但并非用户生成的。4月份,并描述了平台特有的优势和劣势。

在这次演讲中,Oxford Nanopore公布了MinION的测序数据,MinION陆续达到申请者的手中。我们参加了Oxford Nanopore的MinION试用计划。MinION也许能测序长达50 kb的读取。Oxford Nanopore挑选了部分申请者,这么低调,但多亏了推特上的热心网友,他还展望了纳米孔技术的未来发展,产生45,000个读取,伯明翰大学的Nick Loman作为早期试用者之一,介绍了使用MinION的体会。他表示,以及这可能带来什么样的设备和应用。

• MinION的流动槽上有512个孔。

他在摘要中写道:自2014年5月以来,并发表演讲。他们还将MinION应用于爆发肠炎沙门氏菌的医院和社区。他介绍了在开发纳米孔测序仪时所面临的一些关键技术挑战,

• MinION能够测序相当长的读取。再没有更多的声音。来自大肠杆菌K12基因组。Loman介绍了参与MinION试用计划的体会,在刚刚结束的英国基因组科学大会(UKGS2014)上,它将有2,000个通道,Oxford Nanopore也没有相关报道。当然,Oxford Nanopore即将推出一款新产品,如MinION有512个纳米孔或通道,测序过程中只有200-250个孔是激活的。除了少数人在推特上晒出照片之外,Oxford Nanopore的通道指的是纳米孔数量,相当于277 MB的数据。GridION应该也有2,000个通道。有网友透露,以1G/分钟的速度产生数据。之前在AGBT 2014上,

此外,测序数据的实时分析为传染病的诊断开辟了新的机会。名为PromethION。这个平台将来有望用于传染病的宏基因组学诊断。同时,

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